Cụ thể, đối với thuế thu nhập doanh nghiệp, những dự án sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ sẽ được miễn thuế tối đa 4 năm, và giảm 50% số thuế phải nộp tối đa 9 năm tiếp theo được tính từ năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế từ dự án đầu tư. Trường hợp không có thu nhập chịu thuế trong ba năm đầu, kể từ năm đầu tiên có doanh thu từ dự án thì thời gian miễn, giảm thuế được tính từ năm thứ 4.
Đối với thuế thu nhập cá nhân, các chuyên gia đào tạo, chuyển giao công nghệ sẽ được miễn 50% thuế so với mức thuế thu nhập cá nhân thông thường với thời gian tối đa 1 năm.
Cả hai loại thuế trên Bộ Công Thương đề xuất áp dụng thí điểm đến năm 2020.
Bộ Công Thương cũng đề xuất miễn thuế nhập khẩu đối với hàng hóa nhập khẩu để tạo tài sản cố định và phục vụ sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ, bao gồm: thiết bị, máy móc chuyên dùng trong dây chuyền công nghệ sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ trong nước chưa sản xuất được; linh kiện, chi tiết, bộ phận rời, phụ tùng, khuôn mẫu, phụ kiện đi kèm để lắp ráp đồng bộ với thiết bị, máy móc, phương tiện vận tải chuyên dùng. Những nguyên liệu, vật tư trong nước chưa sản xuất được dùng để chế tạo thiết bị, máy móc nằm trong dây chuyền công nghệ hoặc để chế tạo linh kiện, chi tiết, bộ phận rời, phụ tùng, gá lắp, khuôn mẫu, phụ kiện đi kèm để lắp ráp đồng bộ với thiết bị, máy móc trong dự thảo cũng đề nghị cho miễn thuế.
Dự án sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ còn được hỗ trợ một phần chi phí đối với các hạng mục xử lý ô nhiễm, bảo vệ môi trường.
Đối với doanh nghiệp hoạt động trong ngành công nghiệp hỗ trợ lâu nay chủ yếu là doanh nghiệp nhỏ và vừa, thì dự thảo đề xuất nhiều chính sách về ưu đãi tín dụng đầu tư, tiền thuê đất, thuế... cho những doanh nghiệp này.
Cụ thể, các doanh nghiệp nhỏ và vừa có dự án sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ sẽ được hưởng các ưu đãi về tín dụng đầu tư từ từ Quỹ đầu tư công nghiệp hỗ trợ với lãi suất không quá 80% lãi suất vay thương mại, và thời gian vay lên đến 10 năm; và có thể được Qũy tín dụng doanh nghiệp vừa và nhỏ xem xét bảo lãnh.
Các dự án sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ của doanh nghiệp vừa và nhỏ còn được gia hạn nộp thuế 6 tháng kể từ ngày đến thời hạn nộp thuế lần đầu theo quy định của Luật thuế giá trị gia tăng.
Đối với dự án sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ công nghệ cao, dự thảo cũng đề xuất được áp dụng thuế suất ưu đãi như những dự án đầu tư lĩnh vực công nghệ cao gồm thuế suất 10% trong thời gian 15 năm, miễn thuế tối đa trong 4 năm, giảm 50% số thuế phải nộp tối đa trong 9 năm tiếp theo.
Bên cạnh đó, các dự án sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ cho công nghiệp công nghệ cao bên cạnh việc được hưởng các chính sách khuyến khích cho phát triển công nghiệp hỗ trợ còn được hưởng các chính sách khuyến khích về đất đai, thuế thu nhập doanh nghiệp theo quy định của pháp luật về công nghệ cao.
Cụ thể dự thảo đề xuất giảm đến 50% tiền thuê đất trong 11 năm trả cho nhà nước đối với những dự án đầu tư mới nằm ngoài khu công nghiệp, và cả những dự án sản xuất hiện có cũng được ưu đãi này nếu có dự án đổi mới đưa vào hoạt động với năng lực sản xuất tăng ít nhất 20%.
Đối với sản xuất công nghiệp hỗ trợ công nghệ cao, dự thảo cũng nêu rõ, dự án sản xuất sản phẩm công nghiệp hỗ trợ công nghệ cao được áp dụng ưu đãi giống như các dự án đầu tư trong lĩnh vực công nghệ cao như thuế suất 10% trong thời gian 15 năm, miễn thuế tối đa 4 năm, giảm 50% số thuế phải nộp tối đa 9 năm tiếp theo được tính từ năm đầu tiên có thu nhập chịu thuế từ dự án đầu tư.
Tuy nhiên, theo một số doanh nghiệp, dù Chính phủ và các địa phương thường nhấn mạnh ưu tiên phát triển ngành công nghiệp hỗ trợ để phát triển, các doanh nghiệp hoạt động trong ngành này vẫn chưa nhận được sự hỗ trợ nào từ chính sách khuyến khích của nhà nước.
Quyết định về chính sách phát triển một số ngành công nghiệp hỗ trợ số 12/2011/QĐ-TTg, do Thủ tướng Chính phủ ban hành ngày 22-2-2011, được coi là lời tuyên bố chính thức đầu tiên của Chính phủ, ủng hộ dành cho công nghiệp hỗ trợ, nhưng trong thực tế các doanh nghiệp hoạt động trong ngành này cho biết là họ vẫn chưa nhận được hỗ trợ gì.
Một số doanh nghiệp hoạt động sản xuất sản phẩm công nghiệp phụ trợ khác còn than phiền việc đầu tư mở rộng sản xuất quá khó khăn, vì lãi suất ngân hàng cao so với các nước.
